Святитель Феодосій народився у 30-х роках XVII століття у благочестивій дворянській родині. Навчався в Київській Братській школі, де вирішив присвятити себе Богу. Був архідияконом Києво-Софійського собору, ієромонахом Крупицького Батуринського монастиря.
Пізніше, як свідчить Чернігівський літопис, був ігуменом Корсунського монастиря. А у 1664 році святий Феодосій був призначений ігуменом Київського Видубицького монастиря.
Святителя Феодосія знали як людину високодуховну і відповідальну, і, через час, його призначили керуючим справами Київської митрополії. Пізніше він став архімандритом Свято-Успенського Єлецького чоловічого монастиря.
11 вересня 1692 року святитель Феодосій був призначений архієпископом Чернігова та Новгородка (Новгород-Сіверського), а 13 вересня був висвячений у святительский сан.
Свого часу Феодосій Чернігівський був духівником Івана Мазепи, до його смерті гетьман жив благочестиво і проявив себе з кращого боку: побудував багато храмів, був ктитором монастирів.
Помер святитель Феодосій Чернігівський у 1696 році. Його мощі спочивають у Свято-Троїцькому кафедральному соборі Чернігова.
Уже в наш час, після Чорнобильської трагедії у 1986 році, місто Чернігів дуже сильно постраждало. За молитвами святителя Феодосія Чернігівського багато людей отримали зцілення. З тих пір святитель Феодосій Чернігівський є покровителем чорнобильців.